בכל שנה נערכים במוסדות החינוך חיסוני שגרה בהתאם לתוכנית החיסונים של משרד הבריאות, וכן בדיקות סינון: בדיקות ראייה, שמיעה והערכת גדילה ובדיקות שיניים. החיסונים ובדיקות הסינון נערכים בהתאם להנחיות משרד הבריאות ובכפוף להסכמת הורי התלמיד ולהצהרת בריאות. החיסונים והבדיקות ניתנים באמצעות חברות שירותי בריאות התלמיד.
עדכון חשוב – התמודדות עם תחלואה בחצבת במוסדות חינוך בשנת הלימודים תשפ״ו – ראו מכתב הנחיות מטעם משרד הבריאות.
החיסונים מפחיתים באופן משמעותי את הסיכון להידבקות במחלות בעזרת שימוש במקורות ההגנה הטבעיים של הגוף. תרכיבי החיסונים מכילים גרסה מוחלשת או מומתת של וירוסים, המאפשרת למערכת החיסונית להכיר אותם וללמוד כיצד להיערך לקראת זיהומים עתידיים וכך להיאבק בהם בהצלחה. בנוסף להגנה על האדם המחוסן, החיסונים עוזרים לשמור על בריאות הציבור. החיסונים הביאו לירידה משמעותית בתחלואה ובתמותה ממחלות זיהומיות שנגדן מחסנים.
במהלך שנת הלימודים מתבצעות בבית הספר בדיקות שמטרתן לגלות מוקדם ככל האפשר בעיות בריאות בקרב התלמידים. הגילוי המוקדם מאפשר קבלת טיפול יעיל ושיפור התפקוד של הילד בלימודים ובחברה. אם הילד לא נכח מסיבה כלשהי בבית הספר ביום ביצוע הבדיקה, ניתן לפנות לאחות בית הספר ולברר כיצד ניתן להשלים את הבדיקה. ילדים אשר ממצאי בדיקות הסינון שלהם לא היו תקינות יופנו לרופא המטפל.
לכל התלמידים מגן חובה עד כיתה ט' נערכת אחת לשנה בדיקה על ידי רופא שיניים. לאחר הבדיקה ההורים מקבלים הודעה על מצב השיניים של ילדיהם והפניה למרפאת שיניים במידת הצורך.