על גן הילדים לשמש מקום שיתאפשרו בו משחק חופשי, תנועה מגוונת, לימוד ופעילויות שונות, תוך שמירה על בטיחות הילדים השוהים בגן. יצירת סביבה בטוחה דורשת עבודה בשיתוף פעולה של כלל הגורמים המנחים והמעורבים בנושא הבטיחות – מנחים מקצועיים ברמת המטה והמחוז, מנהלי מחלקות גני ילדים, קב"טים, מנהלי בטיחות מוסדות חינוך רשותיים, מפקחים ומנהלות הגן. על מנהלת הגן לפעול לאיתור גורמי סיכון הנראים לעין בגן הילדים, כגון חצר שיש בה מפגעים, מתקני משחקים מסוכנים, משחקים הכוללים כלים בעלי קצוות חדים, דלתות שאינן מוגנות ועלולות לפגוע באצבעות הילדים, רהיטים העלולים לפגוע, מדרגות ללא מעקה ועוד. את אלו עליה לזהות בבדיקה פנימית ותקופתית ולדאוג לתיקון הליקויים על ידי הגורמים המוסמכים.
לפרטים נוספים ראו חוזר מנכ"ל בנושא בטיחות בגני ילדים.
בטיחות הילדים במהלך יום הלימודים בגן ובפעילויות המתרחשות מחוץ לגן היא נושא רגיש ומהותי. ההנחיות מוכתבות על ידי גורמי הביטחון השונים (המשטרה, צה"ל והשב"כ). הקב"טים המחוזיים והקב"טים במוסדות החינוך ברשויות המקומיות הם נדבך חשוב ומרכזי בהבטחת ביטחונם של תלמידי מערכת החינוך בכלל ובתוך גן הילדים בפרט. על כן משרד החינוך מנחה את מנהלות הגן לפעול לביצוע כל הנחיות הביטחון כפי שהועברו על ידי קב"ט הרשות המקומית.